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Seit Doxygen 1.8 wird die Markdown Syntax in Dokumentationsblöcken erkannt. Markdown ist eine minimalistische Formatierungssprache, die von einfachen Text Emails inspiriert ist, die, ähnlich wie die Wiki Syntax, einfach und lesbar sein soll, ohne komplizierten Code wie den in HTML, LaTeX oder Doxygens eigenen Befehlen zu benötigen. Markdown hat bei freier Software an Popularität gewonnen, insbesondere in Online Plattformen wie Github, da es die Erstellung von Dokumentation ohne komplizierten Code ermöglicht. Weitere Informationen finden sich im Abschnitt Markdown Support im Doxygen Handbuch. Besuche die Markdown Webseite, um mehr über den Ursprung und die Philosophie von Markdown zu erfahren.